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Campus Viçosa:
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Agroecologia (Mestrado)
Agroquímica (Mestrado e Doutorado)
Arquitetura e Urbanismo (Mestrado e Doutorado)
Biologia Animal (Mestrado e Doutorado)
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Medicina Veterinária (Mestrado e Doutorado)
Meteorologia Aplicada (Mestrado e Doutorado)
Microbiologia Agrícola (Mestrado e Doutorado)
Multicêntrico em Química de Minas Gerais (Mestrado e Doutorado)
Patrimônio Cultural, Paisagens e Cidadania (Mestrado Profissional)
Química em Rede Nacional (Mestrado Profissional)
Solos e Nutrição de Plantas (Mestrado e Doutorado)
Tecnologia e Celulose de Papel (Mestrado Profissional)
Zootecnia (Mestrado Profissional)
Zootecnia (Mestrado e Doutorado)
Campus Rio Paranaíba
Agronomia (Produção Vegetal) – Mestrado
Administração Pública em Rede Nacional – PROFIAP (Mestrado Profissional
Multicêntrico em Química de Minas Gerais (Mestrado e Doutorado)
Campus Florestal
Manejo e Conservação de Ecossistemas Naturais e Agrários
Matemática em Rede Nacional (Mestrado Profissional)
Educação em Ciências e Matemática (Mestrado Profissional)
Multicêntrico em Química de Minas Gerais (Mestrado e Doutorado)